MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus agalactiae GD201008-001 chromosome

Total Repeats: 46207

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018646	TTG	2	6	8	13	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018646	TTC	2	6	20	25	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_018646	T	7	7	46	52	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018646	AAT	2	6	68	73	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406708524
5	NC_018646	GAA	2	6	92	97	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406708524
6	NC_018646	AAC	2	6	114	119	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406708524
7	NC_018646	CAG	2	6	165	170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406708524
8	NC_018646	T	6	6	179	184	0 %	100 %	0 %	0 %	406708524
9	NC_018646	CTC	2	6	200	205	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406708524
10	NC_018646	TTA	2	6	228	233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406708524
11	NC_018646	TGAAA	2	10	247	256	60 %	20 %	20 %	0 %	406708524
12	NC_018646	ATTTAC	2	12	351	362	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	406708524
13	NC_018646	G	7	7	558	564	0 %	0 %	100 %	0 %	406708524
14	NC_018646	CTA	2	6	587	592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406708524
15	NC_018646	CTG	2	6	651	656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406708524
16	NC_018646	TTA	2	6	663	668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406708524
17	NC_018646	GTCA	2	8	677	684	25 %	25 %	25 %	25 %	406708524
18	NC_018646	GAA	2	6	704	709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406708524
19	NC_018646	AAAAG	2	10	712	721	80 %	0 %	20 %	0 %	406708524
20	NC_018646	TGAT	2	8	744	751	25 %	50 %	25 %	0 %	406708524
21	NC_018646	G	6	6	782	787	0 %	0 %	100 %	0 %	406708524
22	NC_018646	TTC	2	6	800	805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406708524
23	NC_018646	TACA	2	8	822	829	50 %	25 %	0 %	25 %	406708524
24	NC_018646	AGA	2	6	886	891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406708524
25	NC_018646	CAC	2	6	936	941	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406708524
26	NC_018646	ACGT	2	8	1047	1054	25 %	25 %	25 %	25 %	406708524
27	NC_018646	ATG	2	6	1158	1163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406708524
28	NC_018646	AGA	2	6	1189	1194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406708524
29	NC_018646	TAA	2	6	1384	1389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406708524
30	NC_018646	A	6	6	1393	1398	100 %	0 %	0 %	0 %	406708524
31	NC_018646	AAAAT	2	10	1446	1455	80 %	20 %	0 %	0 %	406708524
32	NC_018646	CTA	2	6	1573	1578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_018646	TAC	2	6	1580	1585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_018646	AT	3	6	1599	1604	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018646	AATA	2	8	1631	1638	75 %	25 %	0 %	0 %	406708525
36	NC_018646	TCT	2	6	1645	1650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406708525
37	NC_018646	TTA	2	6	1842	1847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406708525
38	NC_018646	ATT	2	6	1869	1874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406708525
39	NC_018646	AAC	2	6	1915	1920	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406708525
40	NC_018646	ACA	2	6	2004	2009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406708525
41	NC_018646	AAACT	2	10	2029	2038	60 %	20 %	0 %	20 %	406708525
42	NC_018646	ATT	2	6	2049	2054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406708525
43	NC_018646	TGC	2	6	2069	2074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406708525
44	NC_018646	CAA	2	6	2079	2084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406708525
45	NC_018646	AAAT	2	8	2129	2136	75 %	25 %	0 %	0 %	406708525
46	NC_018646	TAA	2	6	2204	2209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406708525
47	NC_018646	GTT	2	6	2220	2225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406708525
48	NC_018646	GAT	2	6	2265	2270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406708525
49	NC_018646	TCT	2	6	2290	2295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406708525
50	NC_018646	CCT	2	6	2378	2383	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406708525
51	NC_018646	CGATT	2	10	2656	2665	20 %	40 %	20 %	20 %	406708525
52	NC_018646	TAA	2	6	2728	2733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406708525
53	NC_018646	ACTA	2	8	2745	2752	50 %	25 %	0 %	25 %	406708525
54	NC_018646	ATG	2	6	2811	2816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406708526
55	NC_018646	TA	4	8	2830	2837	50 %	50 %	0 %	0 %	406708526
56	NC_018646	TAA	2	6	2858	2863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406708526
57	NC_018646	TTG	2	6	2878	2883	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406708526
58	NC_018646	ACAGA	2	10	2931	2940	60 %	0 %	20 %	20 %	406708526
59	NC_018646	GAT	2	6	2943	2948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406708526
60	NC_018646	A	8	8	2950	2957	100 %	0 %	0 %	0 %	406708526
61	NC_018646	AAAG	2	8	2985	2992	75 %	0 %	25 %	0 %	406708526
62	NC_018646	ATC	2	6	2995	3000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406708526
63	NC_018646	AGG	2	6	3011	3016	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406708526
64	NC_018646	TTA	2	6	3071	3076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406708526
65	NC_018646	CAGA	2	8	3150	3157	50 %	0 %	25 %	25 %	406708526
66	NC_018646	TTTA	2	8	3180	3187	25 %	75 %	0 %	0 %	406708526
67	NC_018646	TAAAA	2	10	3260	3269	80 %	20 %	0 %	0 %	406708526
68	NC_018646	A	6	6	3266	3271	100 %	0 %	0 %	0 %	406708526
69	NC_018646	ATT	2	6	3329	3334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406708526
70	NC_018646	TTC	2	6	3338	3343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406708526
71	NC_018646	GA	3	6	3367	3372	50 %	0 %	50 %	0 %	406708526
72	NC_018646	CAG	2	6	3378	3383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406708526
73	NC_018646	T	6	6	3404	3409	0 %	100 %	0 %	0 %	406708526
74	NC_018646	TAT	2	6	3535	3540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406708526
75	NC_018646	TAC	2	6	3560	3565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406708526
76	NC_018646	TTGA	2	8	3627	3634	25 %	50 %	25 %	0 %	406708526
77	NC_018646	A	6	6	3682	3687	100 %	0 %	0 %	0 %	406708526
78	NC_018646	TA	3	6	3694	3699	50 %	50 %	0 %	0 %	406708526
79	NC_018646	TTG	2	6	3733	3738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406708527
80	NC_018646	A	6	6	3744	3749	100 %	0 %	0 %	0 %	406708527
81	NC_018646	ATG	2	6	3858	3863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406708527
82	NC_018646	A	6	6	3891	3896	100 %	0 %	0 %	0 %	406708527
83	NC_018646	AAT	2	6	3927	3932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018646	AAT	2	6	3964	3969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018646	AGA	2	6	4013	4018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018646	GTT	2	6	4055	4060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018646	A	7	7	4210	4216	100 %	0 %	0 %	0 %	406708528
88	NC_018646	ATA	2	6	4234	4239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018646	TAG	2	6	4256	4261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018646	ATT	2	6	4266	4271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018646	CTA	2	6	4278	4283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_018646	CAT	2	6	4403	4408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_018646	TCT	2	6	4418	4423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_018646	T	6	6	4425	4430	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018646	ATA	2	6	4434	4439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018646	TTGA	2	8	4443	4450	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018646	CAG	2	6	4483	4488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406708529
98	NC_018646	TTTA	2	8	4523	4530	25 %	75 %	0 %	0 %	406708529
99	NC_018646	GCT	2	6	4557	4562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406708529
100	NC_018646	TGGTA	2	10	4595	4604	20 %	40 %	40 %	0 %	406708529
101	NC_018646	A	7	7	4653	4659	100 %	0 %	0 %	0 %	406708529
102	NC_018646	AAAT	2	8	4733	4740	75 %	25 %	0 %	0 %	406708529
103	NC_018646	TGA	3	9	4793	4801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406708529
104	NC_018646	TCAA	2	8	4899	4906	50 %	25 %	0 %	25 %	406708529
105	NC_018646	A	6	6	4927	4932	100 %	0 %	0 %	0 %	406708529
106	NC_018646	AGA	2	6	5039	5044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406708529
107	NC_018646	GTT	2	6	5055	5060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406708529
108	NC_018646	AAC	2	6	5078	5083	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406708529
109	NC_018646	TGA	2	6	5111	5116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406708529
110	NC_018646	TGA	2	6	5135	5140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406708529
111	NC_018646	AG	3	6	5180	5185	50 %	0 %	50 %	0 %	406708529
112	NC_018646	AGT	2	6	5192	5197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406708529
113	NC_018646	GAA	3	9	5217	5225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406708529
114	NC_018646	TGA	3	9	5237	5245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406708529
115	NC_018646	ATC	2	6	5317	5322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406708529
116	NC_018646	ACTT	2	8	5337	5344	25 %	50 %	0 %	25 %	406708529
117	NC_018646	CTG	2	6	5347	5352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406708529
118	NC_018646	GCT	2	6	5406	5411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406708529
119	NC_018646	TAT	2	6	5414	5419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406708529
120	NC_018646	ATG	2	6	5467	5472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406708529
121	NC_018646	AAG	2	6	5506	5511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406708529
122	NC_018646	GAA	2	6	5526	5531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406708529
123	NC_018646	TAG	2	6	5586	5591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406708529
124	NC_018646	AAT	2	6	5594	5599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018646	TTA	2	6	5631	5636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018646	TTG	2	6	5685	5690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406708530
127	NC_018646	ATA	2	6	5730	5735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406708530
128	NC_018646	A	6	6	5764	5769	100 %	0 %	0 %	0 %	406708530
129	NC_018646	AGA	2	6	5788	5793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406708530
130	NC_018646	A	6	6	5838	5843	100 %	0 %	0 %	0 %	406708530
131	NC_018646	TTTAT	2	10	5844	5853	20 %	80 %	0 %	0 %	406708530
132	NC_018646	ACT	2	6	5861	5866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406708530
133	NC_018646	CTTA	2	8	5903	5910	25 %	50 %	0 %	25 %	406708530
134	NC_018646	ACA	2	6	5913	5918	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406708530
135	NC_018646	AT	3	6	5942	5947	50 %	50 %	0 %	0 %	406708530
136	NC_018646	GAT	2	6	5948	5953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406708530
137	NC_018646	CTG	2	6	5997	6002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406708530
138	NC_018646	TAT	2	6	6025	6030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406708530
139	NC_018646	TTA	2	6	6102	6107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406708530
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273	NC_018646	TTG	2	6	12186	12191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406708536
274	NC_018646	GTATTG	2	12	12229	12240	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	406708536
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401	NC_018646	GTGA	2	8	16802	16809	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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407	NC_018646	GGA	2	6	17043	17048	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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434	NC_018646	GAAG	2	8	18392	18399	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
435	NC_018646	TAG	2	6	18458	18463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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